Од свог увођења 1970-их, микробна анализа је подвргнута континуираном развоју и побољшању. У почетку се микробна анализа углавном користила за детекцију узорака животне средине, а касније се постепено проширила на области медицине, пољопривреде, биоинжењеринга, итд. Уз континуирани напредак биотехнологије, микробна анализа се такође континуирано иновирала и унапређивала, постајући важна аналитичка метода.
